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Quantité d'ARN et d'ADN requis

Biopuces d’expression WT et 3' IVT Express

Quantité d'ARN total par échantillons 50 à 500 ng d’ARN total par échantillon
Quantitié recommandée : 100 ng
Concentration minimale : 33,3 ng / µl
Volume maximal : 3 µl

Pour une expérience donnée, il est important de débuter l'essai avec la même quantité d'ARN pour tous les échantillons.

À fournir par le chercheur : 2 µg d’ARN total par échantillon dans un microtube de 1,5 ml, certifié "RNase, DNase & Pyrogen-Free", avec les résultats du dosage au spectrophotomètre.

Quantité d’ARN total après purification avec le kit Qiagen RNeasy MinElute :
2 000 ng X 70 % (rendement moyen) = 1 400 ng
Concentration de l’ARN total après élution avec de l’eau "RNase Free" :
1 400 ng / 14 µl = 100 ng / µl

Utilisation de 1 à 2 µl pour l’analyse de la qualité de l’ARN avec le bioanalyseur 2100 d’Agilent et de 1 à 3 µl pour l’essai. Le volume restant sera retourné au chercheur.

Biopuce de génotypage SNP 6.0

Quantité d'ADN génomique double-brin par échantillon : 500 ng
  250 ng pour la réaction Nsp
  250 ng pour la réaction Sty
Concentration : 50 ng / µl
Volume : 10 µl

À fournir par le chercheur : 2 µg d’ADN génomique double-brin par échantillon ou, si préalablement dilué à 50 ng / µl, 40 µl dans un microtube de 1,5 ml, certifié "RNase, DNase & Pyrogen-Free", avec les résultats du dosage au spectrophotomètre.

Utilisation de 10 µl pour vérifier le dosage, de 5 µl pour déposer sur gel afin de vérifier la qualité de l’ADN et de 10 µl pour l’essai. Le volume restant sera retourné au chercheur.

L’ADN génomique doit être remis en suspension avec du TE réduit en EDTA (10 mM Tris, pH 8.0, 0.1 mM EDTA, pH 8.0)

Matériel

  • RNeasy MinElute : QIAGEN, P/N 74204 (GRM: 3027075)
  • RNase Free Water : Invitrogen, P/N 10977-015 (GRM: 3001531)
  • TE réduit : TEKnova/Cedarlane, P/N T0223
  • Microtube de 1,5 ml : Ultident, P/N 24 –MCT-150-C (GRM: 35099)

Information:

Gilles Corbeil,
biopuces@crchum.qc.ca
514 890-8000 poste 23620

 

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